2011年第36週〜2012年第4週の累積では、AH1pdm09が4都府県から5件、AH3亜型が41都道府県から984件、B型はビクトリア系統株が12都府県から32件、山形系統株が12都道府県から32件、系統不明株が10都県から37件報告されている（図２）。

　直近の2011年第51週〜2012年第3週の５週間ではAH1pdm09が3都府県から3件（東京都、大阪府、熊本県各1件）、AH3亜型が34都道府県から509件（神奈川県45件、茨城県、兵庫県各44件、和歌山県39件、長野県30件、栃木県、大阪府各26件、山形県、高知県各22件、東京都21件、岡山県17件、北海道、山梨県各16件、奈良県、山口県各13件、岐阜県12件、富山県11件、三重県、福岡県各10件、新潟県、香川県各9件、愛媛県8件、福島県6件、埼玉県、石川県、福井県、静岡県、島根県、佐賀県各5件、広島県4件、大分県3件、秋田県、千葉県、愛知県各1件）、B型はビクトリア系統株が8県から18件（長野県5件、三重県、兵庫県各4件、山形県、栃木県、新潟県、和歌山県、福岡県各1件）、山形系統株が8道県から11件（神奈川県、富山県、兵庫県各2件、北海道、新潟県、山梨県、長野県、三重県各1件）、系統不明株が6都県から27件（茨城県17件、栃木県、東京都各3件、奈良県2件、山梨県、長野県各1件）報告されている（図３）。
　このうち、輸入例からの分離が4件（AH3亜型シンガポール、スウェーデン、タイ各1件、B型山形系統株グアム1件）報告されている。

下記の表に、地研がNA遺伝子解析により耐性マーカーH275Yを検出した結果および感染研においてオセルタミビル、ザナミビル、ペラミビルおよびラニナミビルに対する薬剤感受性試験を行った結果の集計を示す。集計結果は毎月初めに更新される。