AH1pdmは、2009年第19週〜2010年第19週までに全都道府県から31,435件の分離・検出が報告されており、このうち、15,723件はPCRで検出、12,903件はPCRで検出後ウイルス分離培養も陽性（速報参照：広島県）、2,809件はPCRでは検出されず分離培養のみで陽性となっている（速報参照：横浜市）。また、下気道炎（肺炎、気管支炎）2,824件（速報参照：1.東京都、2.神戸市）、インフルエンザ脳症320件（速報参照：栃木県）、死亡例99件が報告されている。
　同期間（第19週〜第19週）に季節性インフルエンザウイルスの分離・検出はAH1亜型（Aソ連型）が66件、AH3亜型（A香港型）が948件、B型が203件の報告があり、AH1pdmはこの期間の分離・検出例全体の96％を占めている。

　このうち、2009年第19〜35週（2008/09シーズン末）までにAH1pdmが全都道府県から9,724件、AH1亜型が24都府県から66件、AH3亜型が40都道府県から913件、B型が21都道県から103件報告された（図２下）。
　また、輸入例からの分離・検出の報告が、第19〜24週132件（AH1pdm47件、AH1亜型13件、AH3亜型71件、B型1件）、第25〜29週678件（AH1pdm595件、AH1亜型15件、AH3亜型68件）と大きく増加していたが、第30週以降、多くの自治体が疑い例の全例検査を中止したため、第30〜35週148件（AH1pdm126件、AH1亜型1件、AH3亜型21件）と減少した。

　2009/10シーズンには、AH1pdmが2009年第36週〜2010年第19週に全都道府県から21,710件報告されている。AH3亜型は第36〜44週に10道県から15件報告され（速報参照：札幌市）、その後16週間報告がなかったが、第8〜19週に10県から20件報告されている（速報参照：熊本県）。B型は2009年第29週以降報告がなかったが、山形系統株が第47週に1件（速報参照：堺市）、第2週に滋賀県から1件、第9〜10週に2道県から4件、第13〜14週に2道県から3件、第17週に三重県から2件、ビクトリア系統株が第50週に1件（速報参照：新潟県）、第3〜17週に14都道県から78件（速報参照：神戸市）、系統不明株が第5〜16週に5都県から10件報告されている。AH1亜型は第36週以降報告されていない（図２上）。
　このうち、輸入例からの分離・検出が41件（AH1pdm37件、AH3亜型4件）報告されている。