２００４年第６週においては、インフルエンザ様疾患の全国レベル報告数は定点当たり３０.７と第５週の３２.４に比べると若干低下した。これは東日本を中心に２２の都府県で第５週より報告数が低下したことに起因しているが、依然として全国的な流行は続いており、注意報レベルを超えた保健所地域は合計２１５、警報レベルを超えた保健所地域は３４６となっている。報告されているウイルスはA/香港型がほとんどである。