2007年には2〜12月に北海道、宮城県、秋田県、山形県、福島県、茨城県、群馬県、埼玉県、千葉県、東京都、神奈川県、新潟県、石川県、福井県、山梨県、岐阜県、愛知県、三重県、大阪府、兵庫県、和歌山県、島根県、岡山県、広島県、福岡県、佐賀県、熊本県、大分県、宮崎県、沖縄県の30都道府県から482件が報告された。遺伝子型別まで実施された384件中368件ではD5型が検出されており、5月をピークに2〜12月に27都道府県からの報告があった。他にはH1型2件（5月千葉県で中国から帰国して5日後に発症した患者から1件、8月兵庫県で1件）とA型（ワクチンタイプ）14件（ワクチン接種後3週間以内に採取された検体から）が検出された。

　2006年には4〜12月に茨城県、群馬県、千葉県、岐阜県、広島県、沖縄県の6県から55件が報告された。遺伝子型別まで実施された47件中40件ではD5型が検出されており、4〜5月に茨城県（9件）、5〜7月に千葉県（13件）、9〜12月に沖縄県（18件）から報告された。他にはH1型3件（5月に千葉県から3件、うち1件は中国からの帰国前日に発症していた患者から）とA型（ワクチンタイプ）4件（ワクチン接種後2週間以内に採取された検体から）が検出された。