手足口病から分離されたウイルスとして昨年全国的に６〜７月をピークとして報告されたコクサッキーＡ16型（ＣＡ16）は本年に入ってからは１月２株のみで以後報告されていない。これに対し同じく手足口病から分離されたエンテロウイルス71型（ＥＶ71）は，東日本では昨年５月から分離が始まったのに対し，西日本では秋以降分離が増加し，その後も報告が続いている。このような分離状況から，本年の手足口病の流行はＥＶ71が主な病原と考えられるので，このウイルスによる髄膜炎に警戒する必要がある。病原体情報の最近の集計によると，分離総数に対する髄膜炎発生率はＣＡ16の1.4％に対し，ＥＶ71は11％である。